Na oddział chirurgii twarzowo-szczękowej trafiają zawiłe przypadki, takie jak uszkodzenia lub deformacja jamy ustnej. Dotyczy to także kuracji długotrwałych stanów zapalnych oraz wyrywania zębów mądrości, eliminacji wad zgryzu, czy umieszczania implantów. Endodonta, który przeprowadza leczenie kanałowe, wykorzystuje mikroskop, za pomocą którego zabieg jest jak najbardziej dokładny. Dzięki użyciu mikroskopu stomatolog endodonta może uważnie zobaczyć zainfekowaną przez bakterie miazgę zęba oraz ocenić, jak dużą część zęba będzie musiał wyczyścić.